Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms