Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CICQ96RK0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms