Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms