Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PcolceQ61398 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PcolceQ61398 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PcolceQ61398 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PcolceQ61398 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PcolceQ61398 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PcolceQ61398 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PcolceQ61398 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcolceQ61398 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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