Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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