Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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