Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms