Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMSP52788 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMSP52788 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMSP52788 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms