Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OTX2P32243 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OTX2P32243 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
OTX2P32243 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms