Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf47O95873 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms