Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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