Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3550W4VSN7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3550W4VSN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms