Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Padi1Q9Z185 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Padi1Q9Z185 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms