Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne6Q9Z140 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne6Q9Z140 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne6Q9Z140 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms