Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp21Q9QZL6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Usp21Q9QZL6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp21Q9QZL6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp21Q9QZL6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp21Q9QZL6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 477.7 ms