Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh11Q9QYF1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh11Q9QYF1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rdh11Q9QYF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rdh11Q9QYF1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rdh11Q9QYF1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh11Q9QYF1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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