Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LitafQ9JLJ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LitafQ9JLJ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LitafQ9JLJ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms