Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl1Q9JI74 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl1Q9JI74 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl1Q9JI74 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl1Q9JI74 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl1Q9JI74 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl1Q9JI74 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms