Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA9

Gtf2h1, General transcription factor IIH subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h1Q9DBA9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2h1Q9DBA9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2h1Q9DBA9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2h1Q9DBA9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2h1Q9DBA9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms