Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fundc1Q9DB70 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fundc1Q9DB70 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fundc1Q9DB70 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms