Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp4cQ9D7F7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp4cQ9D7F7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp4cQ9D7F7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms