Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc7Q9D541 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc7Q9D541 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc7Q9D541 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms