Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al3Q9D4U4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al3Q9D4U4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms