Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syce1Q9D495 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Syce1Q9D495 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syce1Q9D495 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms