Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldnd1Q9CQX5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldnd1Q9CQX5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldnd1Q9CQX5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms