Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB2

Mcrip2, MAPK regulated corepressor interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip2Q9CQB2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip2Q9CQB2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mcrip2Q9CQB2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip2Q9CQB2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms