Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atoh8Q99NA2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atoh8Q99NA2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms