Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CRBNQ96SW2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CRBNQ96SW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms