Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SnrkQ8VDU5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SnrkQ8VDU5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SnrkQ8VDU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms