Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek9Q8K1R7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nek9Q8K1R7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek9Q8K1R7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nek9Q8K1R7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms