Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LgsnQ8CIX8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LgsnQ8CIX8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms