Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RtknQ8C6B2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RtknQ8C6B2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RtknQ8C6B2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RtknQ8C6B2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtknQ8C6B2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtknQ8C6B2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtknQ8C6B2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtknQ8C6B2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RtknQ8C6B2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms