Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx17Q8BVL3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx17Q8BVL3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx17Q8BVL3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx17Q8BVL3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx17Q8BVL3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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