Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vipas39Q8BGQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vipas39Q8BGQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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