Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubash3bQ8BGG7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
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Ubash3bQ8BGG7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Ubash3bQ8BGG7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubash3bQ8BGG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms