Protein–RNA interactions for Protein: Q80VA5

Sh3tc2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc2Q80VA5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc2Q80VA5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3tc2Q80VA5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sh3tc2Q80VA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3tc2Q80VA5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms