Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GypcQ78HU7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GypcQ78HU7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GypcQ78HU7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.3 ms