Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Higd1cQ76I25 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Higd1cQ76I25 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Higd1cQ76I25 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms