Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim37Q6PCX9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim37Q6PCX9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms