Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtl3Q6P1Y1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl3Q6P1Y1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms