Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf6Q6NVF9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf6Q6NVF9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms