Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzrn3Q69ZS0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 554.2 ms