Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc6Q61143 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc6Q61143 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc6Q61143 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms