Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctf1Q60753 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctf1Q60753 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctf1Q60753 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms