Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Satb1Q60611 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Satb1Q60611 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms