Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C1qtnf9Q4ZJN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C1qtnf9Q4ZJN1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms