Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Palb2Q3U0P1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Palb2Q3U0P1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms