Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Colec11Q3SXB8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec11Q3SXB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colec11Q3SXB8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms