Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax1Q2NKI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vax1Q2NKI2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms