Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edem3Q2HXL6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Edem3Q2HXL6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edem3Q2HXL6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edem3Q2HXL6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms